南京林业大学的现有校训为八个字“诚朴雄伟、树木树人”。
南京林业大学的校训形成有其历史过程。南林前身之一的金陵大学以诚、真、勤、仁四个字为校训，另一前身中央大学提出诚、朴、雄、伟四字学风。上个世纪50年代，南京林业大学正值独立建校时期，工作教学及生活条件艰苦，提出了艰苦创业，团结建校的口号。六十年代，针对林业艰苦特点，结合贯彻高教六十条，号召建立教学相长、民主平等、尊师爱生、团结友爱师生关系。七十年代南林在学生中开展了学雷锋、树新风、创三好活动和贯彻大学生行为准则教育。1986年1月王明庥校长在校首届教职工代表大会上，提出要努力形成和发扬艰苦朴实，严格要求，勤奋进取，勇于创新的校风。
公元1991年3月，南京林业大学根据学校特点和建校以来已形成的优良校风，对干部的作风、教师的教风、学生的学风等进行规范，确定校训为团结、朴实、勤奋、进取。
在办学110周年暨独立建校60周年校庆庆典到来之际，南京林业大学启用新的校训“诚朴雄伟，树木树人”。
“诚朴雄伟，树木树人”中的“诚朴雄伟”源自中央大学校训。梁希、郑万钧诸位名师前辈，秉承此训，为林业科研、林业发展做出了重大贡献，该校予以继承，同时赋予其新的时代精神，将之弘扬光大。“诚”，即真心，诚意。“朴”，即质朴，朴真，朴实，实事求是。“雄”，即雄壮、雄伟、称雄。“伟”，即伟大、崇高、卓越。“诚朴雄伟”是优质的教师、优秀的学生、杰出的人才必须具有的品德、精神、学识、目标、理念的训导。
“树木、树人”与学校发展历史吻合，同时对当下多科性大学人才培养、科学研究等工作具有普遍指导意义。“树木”，既是学校传统优势林科的职责与使命，同时也指出了事物发展尤其是科学研究的规律：耐得寂寞，坚守坚持，才能有所成长、有所收获。相比“树木”，“树人”的工作更是长久之计、不易之事，“树人”是学校与教师应履行的首要任务，也是根本任务和神圣使命。无论“树木”还是“树人”都要遵守一个规律，只有根深蒂固，才能枝繁叶茂;只有广泛吸取营养，才能长成参天大树。这与该校从林科到9大门类的多学科协调发展道理一致。
“诚朴雄伟、树木树人”，作为南京林业大学的校训，正在教育、指导、激励全校师生，为把学校建设成为以林科为特色，以资源、生态和环境类学科为优势，理、工、农、文、管、经、哲、法、艺等多学科协调发展，在国内有地位，国际有影响的高水平特色大学，为实现建设生态型国家、人力资源大国的战略目标，凝心聚力，团结拼搏，创新发展。
